Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms