Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn22Q9D7U6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn22Q9D7U6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn22Q9D7U6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn22Q9D7U6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn22Q9D7U6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn22Q9D7U6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn22Q9D7U6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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