Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clic3Q9D7P7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Clic3Q9D7P7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clic3Q9D7P7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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