Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms