Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3a3Q9D554 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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