Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms