Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4933402D24RikQ9D4D3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms