Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syce1Q9D495 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms