Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx29Q9D3S3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms