Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrnp35Q9D384 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms