Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Obox1Q9D350 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Obox1Q9D350 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Obox1Q9D350 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Obox1Q9D350 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Obox1Q9D350 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Obox1Q9D350 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Obox1Q9D350 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms