Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Mrpl28Q9D1B9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Mrpl28Q9D1B9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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