Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms