Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbed3Q9D0L1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbed3Q9D0L1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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