Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfc5Q9D0F6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms