Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc47Q9D024 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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