Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Shmt2Q9CZN7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Shmt2Q9CZN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Shmt2Q9CZN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Shmt2Q9CZN7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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