Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms