Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Utp23Q9CX11 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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