Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn3Q9CVD2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn3Q9CVD2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms