Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms