Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znhit3Q9CQK1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znhit3Q9CQK1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms