Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Tmed6Q9CQG0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmed6Q9CQG0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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