Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rab5aQ9CQD1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms