Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubl4bQ9CQ84 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubl4bQ9CQ84 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubl4bQ9CQ84 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms