Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms