Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms