Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80bQ99PT3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms