Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms