Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tsnaxip1Q99P25 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms