Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b1Q99NB9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms