Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubqln4Q99NB8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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