Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hdac9Q99N13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdac9Q99N13 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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