Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms