Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms