Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a9Q99MR3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a9Q99MR3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms