Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms