Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PtprtQ99M80 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PtprtQ99M80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PtprtQ99M80 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PtprtQ99M80 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprtQ99M80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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