Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clp1Q99LI9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clp1Q99LI9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms