Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vmp1Q99KU0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmp1Q99KU0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vmp1Q99KU0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vmp1Q99KU0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vmp1Q99KU0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vmp1Q99KU0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmp1Q99KU0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vmp1Q99KU0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmp1Q99KU0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vmp1Q99KU0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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