Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmagpQ99KC7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms