Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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