Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Csmd1Q923L3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Csmd1Q923L3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Csmd1Q923L3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Csmd1Q923L3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Csmd1Q923L3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Csmd1Q923L3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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