Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim59Q922Y2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms