Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms