Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nek8Q91ZR4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek8Q91ZR4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek8Q91ZR4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek8Q91ZR4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek8Q91ZR4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek8Q91ZR4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms