Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms