Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms