Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps36Q91XD6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms