Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd3Q91W18 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd3Q91W18 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms